Die 40 siegreichen Teams der 1. Hauptrunde im UEFA Pokal haben sich für die Gruppenphase qualifiziert, welche in acht Gruppen mit jeweils fünf Mannschaften ausgetragen wird. Jede Mannschaft muss in der Gruppenphase vier Begegnungen absolvieren, zwei zu Hause und zwei auswärts. Die drei Erstplatzierten jeder Gruppe bestreiten anschließend gemeinsam mit den acht Drittplatzierten der Champions League-Gruppenphase die Runde der letzten 32 im UEFA Cup, welche dann wieder traditionell mit Hin- und Rückspielen nach dem KO-System weitergeht, bis schließlich die beiden Finalteilnehmer feststehen.
Die Spielpaarungen der Gruppenphase des UEFA Pokal 2008/2009 erhalten Sie über die o.g. Links. Die Spieltage der Gruppenphase, über deren Ergebnisse wir Sie hier jeweils aktuell informieren, liegen zwischen dem 23. Oktober 2008 und dem 18. Dezember 2008.